Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPTSSBQ8NFR3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SPTSSBQ8NFR3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SPTSSBQ8NFR3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SPTSSBQ8NFR3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SPTSSBQ8NFR3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SPTSSBQ8NFR3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SPTSSBQ8NFR3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPTSSBQ8NFR3 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms