Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB12

SMYD1, Histone-lysine N-methyltransferase SMYD1, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD1Q8NB12 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SMYD1Q8NB12 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SMYD1Q8NB12 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SMYD1Q8NB12 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SMYD1Q8NB12 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD1Q8NB12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SMYD1Q8NB12 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SMYD1Q8NB12 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SMYD1Q8NB12 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SMYD1Q8NB12 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SMYD1Q8NB12 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMYD1Q8NB12 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMYD1Q8NB12 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SMYD1Q8NB12 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SMYD1Q8NB12 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms