Protein–RNA interactions for Protein: Q8N999

C12orf29, Uncharacterized protein C12orf29, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf29Q8N999 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
C12orf29Q8N999 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
C12orf29Q8N999 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
C12orf29Q8N999 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
C12orf29Q8N999 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C12orf29Q8N999 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf29Q8N999 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C12orf29Q8N999 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C12orf29Q8N999 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
C12orf29Q8N999 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
C12orf29Q8N999 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
C12orf29Q8N999 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
C12orf29Q8N999 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
C12orf29Q8N999 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C12orf29Q8N999 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
C12orf29Q8N999 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
C12orf29Q8N999 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
C12orf29Q8N999 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
C12orf29Q8N999 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
C12orf29Q8N999 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
C12orf29Q8N999 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms