Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6M0

OTUD6B, OTU domain-containing protein 6B, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD6BQ8N6M0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OTUD6BQ8N6M0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OTUD6BQ8N6M0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
OTUD6BQ8N6M0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
OTUD6BQ8N6M0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OTUD6BQ8N6M0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
OTUD6BQ8N6M0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
OTUD6BQ8N6M0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
OTUD6BQ8N6M0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
OTUD6BQ8N6M0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OTUD6BQ8N6M0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms