Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5J4

SPIC, Transcription factor Spi-C, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPICQ8N5J4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SPICQ8N5J4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SPICQ8N5J4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPICQ8N5J4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPICQ8N5J4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPICQ8N5J4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPICQ8N5J4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPICQ8N5J4 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPICQ8N5J4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SPICQ8N5J4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SPICQ8N5J4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPICQ8N5J4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SPICQ8N5J4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SPICQ8N5J4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SPICQ8N5J4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPICQ8N5J4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPICQ8N5J4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms