Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4N3

KLHL36, Kelch-like protein 36, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL36Q8N4N3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL36Q8N4N3 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KLHL36Q8N4N3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KLHL36Q8N4N3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KLHL36Q8N4N3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KLHL36Q8N4N3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KLHL36Q8N4N3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KLHL36Q8N4N3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL36Q8N4N3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KLHL36Q8N4N3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL36Q8N4N3 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL36Q8N4N3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL36Q8N4N3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL36Q8N4N3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL36Q8N4N3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL36Q8N4N3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL36Q8N4N3 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL36Q8N4N3 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
KLHL36Q8N4N3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
KLHL36Q8N4N3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KLHL36Q8N4N3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLHL36Q8N4N3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLHL36Q8N4N3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms