Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4B5

PRR18, Proline-rich protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR18Q8N4B5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PRR18Q8N4B5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRR18Q8N4B5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PRR18Q8N4B5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PRR18Q8N4B5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PRR18Q8N4B5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PRR18Q8N4B5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PRR18Q8N4B5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRR18Q8N4B5 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRR18Q8N4B5 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms