Protein–RNA interactions for Protein: Q8N145

LGI3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGI3Q8N145 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LGI3Q8N145 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI3Q8N145 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LGI3Q8N145 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LGI3Q8N145 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LGI3Q8N145 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LGI3Q8N145 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LGI3Q8N145 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LGI3Q8N145 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LGI3Q8N145 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LGI3Q8N145 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LGI3Q8N145 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LGI3Q8N145 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms