Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CCDC50Q8IVM0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC50Q8IVM0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC50Q8IVM0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC50Q8IVM0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC50Q8IVM0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CCDC50Q8IVM0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CCDC50Q8IVM0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC50Q8IVM0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CCDC50Q8IVM0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CCDC50Q8IVM0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CCDC50Q8IVM0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC50Q8IVM0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CCDC50Q8IVM0 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CCDC50Q8IVM0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CCDC50Q8IVM0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms