Protein–RNA interactions for Protein: Q86X45

LRRC6, Protein tilB homolog, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC6Q86X45 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC6Q86X45 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC6Q86X45 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
LRRC6Q86X45 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC6Q86X45 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC6Q86X45 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC6Q86X45 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC6Q86X45 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC6Q86X45 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC6Q86X45 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC6Q86X45 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC6Q86X45 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC6Q86X45 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC6Q86X45 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms