Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
NLRP13Q86W25 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
NLRP13Q86W25 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC38.69■■■■□ 3.78
NLRP13Q86W25 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
NLRP13Q86W25 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.6■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.59■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.58■■■■□ 3.77
NLRP13Q86W25 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NLRP13Q86W25 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NLRP13Q86W25 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NLRP13Q86W25 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC38.49■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
NLRP13Q86W25 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC38.44■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NLRP13Q86W25 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NLRP13Q86W25 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NLRP13Q86W25 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
NLRP13Q86W25 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NLRP13Q86W25 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NLRP13Q86W25 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC38.26■■■■□ 3.72
NLRP13Q86W25 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NLRP13Q86W25 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NLRP13Q86W25 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
NLRP13Q86W25 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC38.17■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
NLRP13Q86W25 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC38.12■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
NLRP13Q86W25 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
NLRP13Q86W25 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
NLRP13Q86W25 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NLRP13Q86W25 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
NLRP13Q86W25 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
NLRP13Q86W25 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC38.04■■■■□ 3.68
NLRP13Q86W25 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
NLRP13Q86W25 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NLRP13Q86W25 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
NLRP13Q86W25 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NLRP13Q86W25 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NLRP13Q86W25 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NLRP13Q86W25 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NLRP13Q86W25 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC37.88■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms