Protein–RNA interactions for Protein: Q86TJ5

ZNF554, Zinc finger protein 554, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF554Q86TJ5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF554Q86TJ5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF554Q86TJ5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF554Q86TJ5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF554Q86TJ5 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZNF554Q86TJ5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZNF554Q86TJ5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ZNF554Q86TJ5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ZNF554Q86TJ5 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ZNF554Q86TJ5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ZNF554Q86TJ5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZNF554Q86TJ5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZNF554Q86TJ5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ZNF554Q86TJ5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF554Q86TJ5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF554Q86TJ5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF554Q86TJ5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms