Protein–RNA interactions for Protein: Q86TB9

PATL1, Protein PAT1 homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL1Q86TB9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PATL1Q86TB9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
PATL1Q86TB9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PATL1Q86TB9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PATL1Q86TB9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PATL1Q86TB9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PATL1Q86TB9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL1Q86TB9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PATL1Q86TB9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PATL1Q86TB9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL1Q86TB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PATL1Q86TB9 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PATL1Q86TB9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PATL1Q86TB9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PATL1Q86TB9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PATL1Q86TB9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms