Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
HACD2Q6Y1H2 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
HACD2Q6Y1H2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HACD2Q6Y1H2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HACD2Q6Y1H2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HACD2Q6Y1H2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HACD2Q6Y1H2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HACD2Q6Y1H2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HACD2Q6Y1H2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HACD2Q6Y1H2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HACD2Q6Y1H2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HACD2Q6Y1H2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HACD2Q6Y1H2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HACD2Q6Y1H2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.6 ms