Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXU4

GSG1L, Germ cell-specific gene 1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSG1LQ6UXU4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GSG1LQ6UXU4 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GSG1LQ6UXU4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GSG1LQ6UXU4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GSG1LQ6UXU4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GSG1LQ6UXU4 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GSG1LQ6UXU4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GSG1LQ6UXU4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
GSG1LQ6UXU4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GSG1LQ6UXU4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GSG1LQ6UXU4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GSG1LQ6UXU4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms