Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXS9

CASP12, Inactive caspase-12, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP12Q6UXS9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASP12Q6UXS9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP12Q6UXS9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASP12Q6UXS9 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASP12Q6UXS9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASP12Q6UXS9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP12Q6UXS9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CASP12Q6UXS9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CASP12Q6UXS9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CASP12Q6UXS9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CASP12Q6UXS9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CASP12Q6UXS9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CASP12Q6UXS9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CASP12Q6UXS9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CASP12Q6UXS9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASP12Q6UXS9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms