Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXD1

HRCT1, Histidine-rich carboxyl terminus protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCT1Q6UXD1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
HRCT1Q6UXD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
HRCT1Q6UXD1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HRCT1Q6UXD1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
HRCT1Q6UXD1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HRCT1Q6UXD1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HRCT1Q6UXD1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HRCT1Q6UXD1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HRCT1Q6UXD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms