Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY0

BLOC1S3, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S3Q6QNY0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BLOC1S3Q6QNY0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BLOC1S3Q6QNY0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BLOC1S3Q6QNY0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BLOC1S3Q6QNY0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BLOC1S3Q6QNY0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
BLOC1S3Q6QNY0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
BLOC1S3Q6QNY0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
BLOC1S3Q6QNY0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
BLOC1S3Q6QNY0 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BLOC1S3Q6QNY0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
BLOC1S3Q6QNY0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BLOC1S3Q6QNY0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
BLOC1S3Q6QNY0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
BLOC1S3Q6QNY0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
BLOC1S3Q6QNY0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
BLOC1S3Q6QNY0 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms