Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIL6

KCNIP4, Kv channel-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP4Q6PIL6 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
KCNIP4Q6PIL6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNIP4Q6PIL6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
KCNIP4Q6PIL6 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNIP4Q6PIL6 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KCNIP4Q6PIL6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KCNIP4Q6PIL6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
KCNIP4Q6PIL6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
KCNIP4Q6PIL6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
KCNIP4Q6PIL6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms