Protein–RNA interactions for Protein: Q6EKJ0

GTF2IRD2B, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GTF2IRD2BQ6EKJ0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF2IRD2BQ6EKJ0 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms