Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWC8

HACD4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD4Q5VWC8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HACD4Q5VWC8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HACD4Q5VWC8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HACD4Q5VWC8 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HACD4Q5VWC8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HACD4Q5VWC8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HACD4Q5VWC8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HACD4Q5VWC8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HACD4Q5VWC8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HACD4Q5VWC8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HACD4Q5VWC8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HACD4Q5VWC8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms