Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU97

CACHD1, VWFA and cache domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACHD1Q5VU97 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CACHD1Q5VU97 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CACHD1Q5VU97 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CACHD1Q5VU97 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CACHD1Q5VU97 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CACHD1Q5VU97 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CACHD1Q5VU97 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CACHD1Q5VU97 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CACHD1Q5VU97 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CACHD1Q5VU97 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CACHD1Q5VU97 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms