Protein–RNA interactions for Protein: Q5RGS3

FAM74A1, Protein FAM74A1, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM74A1Q5RGS3 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
FAM74A1Q5RGS3 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FAM74A1Q5RGS3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
FAM74A1Q5RGS3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FAM74A1Q5RGS3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM74A1Q5RGS3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FAM74A1Q5RGS3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FAM74A1Q5RGS3 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM74A1Q5RGS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FAM74A1Q5RGS3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FAM74A1Q5RGS3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
FAM74A1Q5RGS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FAM74A1Q5RGS3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
FAM74A1Q5RGS3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms