Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHLDA2Q53GA4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PHLDA2Q53GA4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHLDA2Q53GA4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHLDA2Q53GA4 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDA2Q53GA4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHLDA2Q53GA4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHLDA2Q53GA4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHLDA2Q53GA4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PHLDA2Q53GA4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PHLDA2Q53GA4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PHLDA2Q53GA4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PHLDA2Q53GA4 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PHLDA2Q53GA4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PHLDA2Q53GA4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms