Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
PMCHL1Q16048 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PMCHL1Q16048 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PMCHL1Q16048 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PMCHL1Q16048 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PMCHL1Q16048 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PMCHL1Q16048 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PMCHL1Q16048 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PMCHL1Q16048 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
PMCHL1Q16048 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms