Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 EFR3A-206ENST00000522709 780 ntTSL 516.91■□□□□ 0.31e-26■■■■■ 100.3
PCBP2Q15366 ZNF644-202ENST00000347275 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.953e-24■■■■■ 99.2
PCBP2Q15366 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.07□□□□□ -1.443e-24■■■■■ 99.2
PCBP2Q15366 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.515e-26■■■■■ 98.7
PCBP2Q15366 SSBP3-210ENST00000525990 701 ntTSL 211.17□□□□□ -0.625e-26■■■■■ 98.7
PCBP2Q15366 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.977e-8■■■■■ 98.5
PCBP2Q15366 RAB11FIP3-203ENST00000434585 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.92□□□□□ -0.57e-8■■■■■ 98.5
PCBP2Q15366 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.188e-52■■■■■ 97.8
PCBP2Q15366 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.617e-24■■■■■ 97.7
PCBP2Q15366 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.277e-24■■■■■ 97.7
PCBP2Q15366 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 07e-24■■■■■ 97.7
PCBP2Q15366 RCBTB1-204ENST00000490058 373 ntTSL 26.93□□□□□ -1.31e-10■■■■■ 97.1
PCBP2Q15366 TMEM120A-212ENST00000486865 306 ntTSL 311.66□□□□□ -0.548e-21■■■■■ 96.9
PCBP2Q15366 SEPT1-209ENST00000572252 1279 ntTSL 521.3■■□□□ 12e-15■■■■■ 96.9
PCBP2Q15366 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-15■■■■■ 96.9
PCBP2Q15366 SEPT1-210ENST00000573615 1616 ntTSL 519.19■□□□□ 0.662e-15■■■■■ 96.9
PCBP2Q15366 SEPT1-205ENST00000566517 1080 ntTSL 518.49■□□□□ 0.552e-15■■■■■ 96.9
PCBP2Q15366 SEPT1-204ENST00000563957 2738 ntTSL 515.62■□□□□ 0.092e-15■■■■■ 96.9
PCBP2Q15366 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.429e-9■■■■■ 96.8
PCBP2Q15366 ZMYM4-202ENST00000441447 466 ntTSL 58.99□□□□□ -0.972e-20■■■■■ 96.6
PCBP2Q15366 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.342e-20■■■■■ 96.6
PCBP2Q15366 DOT1L-201ENST00000398665 7436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.434e-7■■■■■ 96.1
PCBP2Q15366 ATXN2L-223ENST00000568266 1294 ntTSL 516.19■□□□□ 0.182e-23■■■■■ 96
PCBP2Q15366 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.738e-12■■■■■ 95.4
PCBP2Q15366 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.548e-12■■■■■ 95.4
PCBP2Q15366 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.891e-6■■■■■ 95.3
PCBP2Q15366 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.041e-6■■■■■ 95.3
PCBP2Q15366 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-6■■■■■ 95.3
PCBP2Q15366 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-6■■■■■ 95.3
PCBP2Q15366 SLC38A10-206ENST00000540966 896 ntTSL 315.71■□□□□ 0.117e-9■■■■■ 95.2
PCBP2Q15366 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.067e-9■■■■■ 95.2
PCBP2Q15366 SLC38A10-211ENST00000576151 774 ntTSL 214.36□□□□□ -0.117e-9■■■■■ 95.2
PCBP2Q15366 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 213.68□□□□□ -0.227e-9■■■■■ 95.2
PCBP2Q15366 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.811e-17■■■■■ 94.9
PCBP2Q15366 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.921e-17■■■■■ 94.9
PCBP2Q15366 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.931e-17■■■■■ 94.9
PCBP2Q15366 YTHDC2-205ENST00000512600 6708 ntTSL 24.27□□□□□ -1.734e-70■■■■■ 94.5
PCBP2Q15366 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.965e-23■■■■■ 94.3
PCBP2Q15366 CPE-203ENST00000480404 437 ntTSL 217.47■□□□□ 0.395e-23■■■■■ 94.3
PCBP2Q15366 TMC6-222ENST00000592076 693 ntTSL 315.29■□□□□ 0.045e-23■■■■■ 94.3
PCBP2Q15366 NUBPL-207ENST00000550355 596 ntTSL 417.93■□□□□ 0.461e-8■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 NUBPL-211ENST00000552489 541 ntTSL 416.18■□□□□ 0.181e-8■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 SUCLA2-202ENST00000433022 467 ntTSL 516.67■□□□□ 0.263e-20■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.133e-20■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 SUCLA2-209ENST00000497202 902 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-20■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 SUCLA2-203ENST00000434484 894 ntTSL 513.84□□□□□ -0.193e-20■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 SUCLA2-210ENST00000634878 832 ntTSL 56.16□□□□□ -1.423e-20■■■■■ 94.2
PCBP2Q15366 SEPT9-238ENST00000591472 555 ntTSL 411.55□□□□□ -0.565e-7■■■■■ 93.6
PCBP2Q15366 SEPT9-247ENST00000593189 817 ntTSL 510.69□□□□□ -0.75e-7■■■■■ 93.6
PCBP2Q15366 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.322e-8■■■■■ 93.5
PCBP2Q15366 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 93.5
PCBP2Q15366 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-8■■■■■ 93.5
PCBP2Q15366 SRCAP-203ENST00000411466 836 ntTSL 321.06■□□□□ 0.963e-6■■■■■ 92.8
PCBP2Q15366 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.558e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.438e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.078e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.38e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 PLEKHB2-202ENST00000403716 4349 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.48e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 PLEKHB2-208ENST00000439822 4177 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.578e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 PLEKHB2-201ENST00000234115 4208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.858e-8■■■■■ 92.7
PCBP2Q15366 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.5□□□□□ -0.252e-15■■■■■ 92
PCBP2Q15366 ATP11A-206ENST00000419631 2446 ntTSL 312.88□□□□□ -0.354e-33■■■■■ 91.9
PCBP2Q15366 ATP11A-217ENST00000614170 3542 nt9.66□□□□□ -0.864e-33■■■■■ 91.9
PCBP2Q15366 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.298e-7■■■■■ 91.5
PCBP2Q15366 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.218e-7■■■■■ 91.5
PCBP2Q15366 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.18e-7■■■■■ 91.5
PCBP2Q15366 BRWD3-201ENST00000373275 11381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.26□□□□□ -1.412e-9■■■■■ 91.2
PCBP2Q15366 SAR1A-202ENST00000373238 3227 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.056e-17■■■■■ 91.1
PCBP2Q15366 KLHDC4-221ENST00000568346 343 ntTSL 48.5□□□□□ -1.053e-8■■■■■ 91.1
PCBP2Q15366 ABCD3-204ENST00000468860 661 ntTSL 316.98■□□□□ 0.312e-11■■■■■ 91
PCBP2Q15366 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.572e-11■■■■■ 91
PCBP2Q15366 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.262e-11■■■■■ 91
PCBP2Q15366 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.516e-20■■■■■ 90.9
PCBP2Q15366 WWC1-215ENST00000524228 3408 ntTSL 1 (best)10.98□□□□□ -0.656e-20■■■■■ 90.9
PCBP2Q15366 WWC1-202ENST00000393895 3980 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.936e-20■■■■■ 90.9
PCBP2Q15366 WWC1-209ENST00000521089 3562 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.996e-20■■■■■ 90.9
PCBP2Q15366 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.473e-7■■■■■ 90.8
PCBP2Q15366 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.943e-7■■■■■ 90.8
PCBP2Q15366 SLMAP-214ENST00000467901 2698 ntTSL 27.15□□□□□ -1.263e-7■■■■■ 90.8
PCBP2Q15366 SLMAP-202ENST00000295952 4420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.343e-7■■■■■ 90.8
PCBP2Q15366 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 90.8
PCBP2Q15366 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 90.8
PCBP2Q15366 PAWR-203ENST00000547571 732 ntTSL 320.85■□□□□ 0.932e-10■■■■■ 90.7
PCBP2Q15366 PAWR-210ENST00000551712 1573 ntTSL 318.14■□□□□ 0.492e-10■■■■■ 90.7
PCBP2Q15366 PAWR-208ENST00000550006 493 ntTSL 318.07■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 90.7
PCBP2Q15366 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.583e-7■■■■■ 90.7
PCBP2Q15366 LIN7A-202ENST00000549417 905 ntTSL 1 (best)6.5□□□□□ -1.371e-26■■■■■ 90.6
PCBP2Q15366 ATP13A3-210ENST00000497567 532 ntTSL 48.01□□□□□ -1.133e-26■■■■■ 89.7
PCBP2Q15366 ATP13A3-202ENST00000429136 3729 ntTSL 1 (best)5.31□□□□□ -1.563e-26■■■■■ 89.7
PCBP2Q15366 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.693e-26■■■■■ 89.7
PCBP2Q15366 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.813e-26■■■■■ 89.7
PCBP2Q15366 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.13e-26■■■■■ 89.7
PCBP2Q15366 EXOC3L4-203ENST00000559661 665 ntTSL 516.76■□□□□ 0.277e-11■■■■■ 89.6
PCBP2Q15366 DSTYK-202ENST00000367162 7874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.694e-23■■■■■ 89.6
PCBP2Q15366 DSTYK-201ENST00000367161 7739 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.744e-23■■■■■ 89.6
PCBP2Q15366 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.054e-7■■■■■ 89.3
PCBP2Q15366 SMYD3-207ENST00000462422 971 ntTSL 512.25□□□□□ -0.454e-7■■■■■ 89.3
PCBP2Q15366 SMYD3-218ENST00000630181 1458 ntTSL 2 BASIC8.29□□□□□ -1.084e-7■■■■■ 89.3
PCBP2Q15366 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 45.25□□□□□ -1.574e-7■■■■■ 89.3
PCBP2Q15366 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.693e-10■■■■■ 89.1
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