Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCLAFQ15004 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCLAFQ15004 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCLAFQ15004 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCLAFQ15004 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCLAFQ15004 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCLAFQ15004 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PCLAFQ15004 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PCLAFQ15004 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PCLAFQ15004 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PCLAFQ15004 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCLAFQ15004 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCLAFQ15004 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PCLAFQ15004 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PCLAFQ15004 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
PCLAFQ15004 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PCLAFQ15004 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PCLAFQ15004 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PCLAFQ15004 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PCLAFQ15004 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PCLAFQ15004 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PCLAFQ15004 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
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