Protein–RNA interactions for Protein: Q14994

NR1I3, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 3, humanhuman

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1I3Q14994 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR1I3Q14994 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NR1I3Q14994 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NR1I3Q14994 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
NR1I3Q14994 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
NR1I3Q14994 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC30.46■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
NR1I3Q14994 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
NR1I3Q14994 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
NR1I3Q14994 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
NR1I3Q14994 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NR1I3Q14994 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
NR1I3Q14994 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
NR1I3Q14994 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
NR1I3Q14994 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
NR1I3Q14994 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
NR1I3Q14994 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
NR1I3Q14994 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
NR1I3Q14994 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
NR1I3Q14994 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
NR1I3Q14994 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
NR1I3Q14994 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
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