Protein–RNA interactions for Protein: Q14691

GINS1, DNA replication complex GINS protein PSF1, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1Q14691 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GINS1Q14691 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS1Q14691 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS1Q14691 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GINS1Q14691 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS1Q14691 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GINS1Q14691 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GINS1Q14691 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GINS1Q14691 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GINS1Q14691 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GINS1Q14691 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINS1Q14691 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GINS1Q14691 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GINS1Q14691 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GINS1Q14691 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
GINS1Q14691 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GINS1Q14691 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GINS1Q14691 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GINS1Q14691 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
GINS1Q14691 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
GINS1Q14691 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
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