Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN1Q13671 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RIN1Q13671 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RIN1Q13671 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RIN1Q13671 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RIN1Q13671 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RIN1Q13671 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RIN1Q13671 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIN1Q13671 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RIN1Q13671 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RIN1Q13671 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RIN1Q13671 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN1Q13671 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RIN1Q13671 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
RIN1Q13671 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RIN1Q13671 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RIN1Q13671 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN1Q13671 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN1Q13671 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN1Q13671 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RIN1Q13671 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN1Q13671 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIN1Q13671 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms