Protein–RNA interactions for Protein: Q13522

PPP1R1A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1A, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R1AQ13522 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPP1R1AQ13522 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PPP1R1AQ13522 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PPP1R1AQ13522 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PPP1R1AQ13522 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PPP1R1AQ13522 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PPP1R1AQ13522 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PPP1R1AQ13522 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PPP1R1AQ13522 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R1AQ13522 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PPP1R1AQ13522 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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