Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MRPL28Q13084 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MRPL28Q13084 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MRPL28Q13084 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MRPL28Q13084 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MRPL28Q13084 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MRPL28Q13084 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MRPL28Q13084 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MRPL28Q13084 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MRPL28Q13084 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MRPL28Q13084 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MRPL28Q13084 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
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