Protein–RNA interactions for Protein: Q12951

FOXI1, Forkhead box protein I1, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI1Q12951 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FOXI1Q12951 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FOXI1Q12951 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
FOXI1Q12951 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXI1Q12951 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXI1Q12951 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
FOXI1Q12951 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
FOXI1Q12951 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
FOXI1Q12951 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms