Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PTPN13Q12923 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PTPN13Q12923 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PTPN13Q12923 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PTPN13Q12923 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPN13Q12923 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPN13Q12923 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPN13Q12923 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPN13Q12923 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPN13Q12923 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPN13Q12923 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PTPN13Q12923 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PTPN13Q12923 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PTPN13Q12923 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PTPN13Q12923 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PTPN13Q12923 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PTPN13Q12923 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN13Q12923 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PTPN13Q12923 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN13Q12923 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PTPN13Q12923 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN13Q12923 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN13Q12923 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PTPN13Q12923 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PTPN13Q12923 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN13Q12923 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PTPN13Q12923 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTPN13Q12923 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTPN13Q12923 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTPN13Q12923 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTPN13Q12923 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTPN13Q12923 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTPN13Q12923 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTPN13Q12923 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN13Q12923 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
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