Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CDK17Q00537 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
CDK17Q00537 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK17Q00537 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CDK17Q00537 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.14■■■□□ 2.42
CDK17Q00537 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
CDK17Q00537 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
CDK17Q00537 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
CDK17Q00537 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
CDK17Q00537 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CDK17Q00537 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CDK17Q00537 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CDK17Q00537 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CDK17Q00537 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK17Q00537 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CDK17Q00537 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.36
CDK17Q00537 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CDK17Q00537 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CDK17Q00537 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CDK17Q00537 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
CDK17Q00537 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CDK17Q00537 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms