Protein–RNA interactions for Protein: P85037

FOXK1, Forkhead box protein K1, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXK1P85037 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
FOXK1P85037 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
FOXK1P85037 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
FOXK1P85037 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXK1P85037 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXK1P85037 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
FOXK1P85037 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
FOXK1P85037 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FOXK1P85037 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FOXK1P85037 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOXK1P85037 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
FOXK1P85037 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FOXK1P85037 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
FOXK1P85037 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FOXK1P85037 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FOXK1P85037 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms