Protein–RNA interactions for Protein: P78358

CTAG1A, Cancer/testis antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAG1AP78358 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CTAG1AP78358 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CTAG1AP78358 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CTAG1AP78358 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CTAG1AP78358 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CTAG1AP78358 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTAG1AP78358 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CTAG1AP78358 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CTAG1AP78358 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CTAG1AP78358 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTAG1AP78358 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CTAG1AP78358 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CTAG1AP78358 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTAG1AP78358 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CTAG1AP78358 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTAG1AP78358 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CTAG1AP78358 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CTAG1AP78358 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CTAG1AP78358 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CTAG1AP78358 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CTAG1AP78358 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms