Protein–RNA interactions for Protein: P68371

TUBB4B, Tubulin beta-4B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB4BP68371 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
TUBB4BP68371 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
TUBB4BP68371 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
TUBB4BP68371 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB4BP68371 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
TUBB4BP68371 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
TUBB4BP68371 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TUBB4BP68371 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
TUBB4BP68371 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TUBB4BP68371 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB4BP68371 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB4BP68371 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TUBB4BP68371 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TUBB4BP68371 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
TUBB4BP68371 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TUBB4BP68371 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
TUBB4BP68371 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TUBB4BP68371 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TUBB4BP68371 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TUBB4BP68371 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
TUBB4BP68371 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TUBB4BP68371 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TUBB4BP68371 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TUBB4BP68371 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TUBB4BP68371 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TUBB4BP68371 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
TUBB4BP68371 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TUBB4BP68371 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TUBB4BP68371 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TUBB4BP68371 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TUBB4BP68371 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TUBB4BP68371 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TUBB4BP68371 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms