Protein–RNA interactions for Protein: P62955

CACNG7, Voltage-dependent calcium channel gamma-7 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG7P62955 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG7P62955 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CACNG7P62955 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CACNG7P62955 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CACNG7P62955 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CACNG7P62955 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CACNG7P62955 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CACNG7P62955 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNG7P62955 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CACNG7P62955 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CACNG7P62955 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNG7P62955 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms