Protein–RNA interactions for Protein: P62917

RPL8, 60S ribosomal protein L8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL8P62917 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL8P62917 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL8P62917 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL8P62917 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL8P62917 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL8P62917 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL8P62917 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL8P62917 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL8P62917 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL8P62917 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL8P62917 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL8P62917 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL8P62917 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL8P62917 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL8P62917 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL8P62917 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL8P62917 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL8P62917 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL8P62917 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL8P62917 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL8P62917 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL8P62917 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL8P62917 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL8P62917 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL8P62917 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL8P62917 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL8P62917 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL8P62917 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL8P62917 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL8P62917 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL8P62917 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL8P62917 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL8P62917 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL8P62917 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL8P62917 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL8P62917 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL8P62917 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL8P62917 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL8P62917 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL8P62917 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL8P62917 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL8P62917 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL8P62917 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL8P62917 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL8P62917 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL8P62917 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL8P62917 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL8P62917 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL8P62917 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL8P62917 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL8P62917 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL8P62917 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL8P62917 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL8P62917 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL8P62917 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL8P62917 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL8P62917 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL8P62917 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL8P62917 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL8P62917 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL8P62917 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL8P62917 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL8P62917 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL8P62917 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL8P62917 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL8P62917 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL8P62917 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL8P62917 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL8P62917 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL8P62917 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL8P62917 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPL8P62917 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPL8P62917 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL8P62917 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPL8P62917 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL8P62917 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RPL8P62917 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPL8P62917 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RPL8P62917 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL8P62917 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RPL8P62917 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPL8P62917 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPL8P62917 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL8P62917 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPL8P62917 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL8P62917 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPL8P62917 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RPL8P62917 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPL8P62917 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPL8P62917 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPL8P62917 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL8P62917 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL8P62917 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPL8P62917 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL8P62917 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL8P62917 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPL8P62917 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL8P62917 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL8P62917 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPL8P62917 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms