Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11AP62491 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11AP62491 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB11AP62491 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RAB11AP62491 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB11AP62491 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RAB11AP62491 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB11AP62491 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB11AP62491 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB11AP62491 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB11AP62491 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB11AP62491 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB11AP62491 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms