Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
PSMC6P62333 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
PSMC6P62333 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
PSMC6P62333 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
PSMC6P62333 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
PSMC6P62333 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
PSMC6P62333 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
PSMC6P62333 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
PSMC6P62333 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PSMC6P62333 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
PSMC6P62333 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
PSMC6P62333 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
PSMC6P62333 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSMC6P62333 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
PSMC6P62333 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.61■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
PSMC6P62333 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSMC6P62333 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSMC6P62333 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.43■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PSMC6P62333 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PSMC6P62333 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSMC6P62333 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PSMC6P62333 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PSMC6P62333 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSMC6P62333 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PSMC6P62333 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PSMC6P62333 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
PSMC6P62333 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PSMC6P62333 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PSMC6P62333 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSMC6P62333 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PSMC6P62333 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSMC6P62333 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
PSMC6P62333 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PSMC6P62333 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PSMC6P62333 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSMC6P62333 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
PSMC6P62333 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSMC6P62333 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PSMC6P62333 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms