Protein–RNA interactions for Protein: P62079

TSPAN5, Tetraspanin-5, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN5P62079 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TSPAN5P62079 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TSPAN5P62079 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSPAN5P62079 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSPAN5P62079 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSPAN5P62079 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSPAN5P62079 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TSPAN5P62079 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSPAN5P62079 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TSPAN5P62079 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TSPAN5P62079 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TSPAN5P62079 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms