Protein–RNA interactions for Protein: P61266

STX1B, Syntaxin-1B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX1BP61266 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1BP61266 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1BP61266 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
STX1BP61266 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
STX1BP61266 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1BP61266 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
STX1BP61266 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
STX1BP61266 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
STX1BP61266 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STX1BP61266 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STX1BP61266 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
STX1BP61266 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
STX1BP61266 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1BP61266 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1BP61266 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
STX1BP61266 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
STX1BP61266 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
STX1BP61266 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
STX1BP61266 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
STX1BP61266 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
STX1BP61266 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1BP61266 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1BP61266 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1BP61266 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1BP61266 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
STX1BP61266 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX1BP61266 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX1BP61266 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
STX1BP61266 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
STX1BP61266 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX1BP61266 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX1BP61266 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
STX1BP61266 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
STX1BP61266 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1BP61266 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
STX1BP61266 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
STX1BP61266 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1BP61266 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
STX1BP61266 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
STX1BP61266 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
STX1BP61266 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
STX1BP61266 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1BP61266 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1BP61266 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
STX1BP61266 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1BP61266 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
STX1BP61266 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1BP61266 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
STX1BP61266 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
STX1BP61266 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX1BP61266 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
STX1BP61266 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
STX1BP61266 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
STX1BP61266 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
STX1BP61266 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1BP61266 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1BP61266 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
STX1BP61266 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1BP61266 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1BP61266 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1BP61266 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
STX1BP61266 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX1BP61266 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
STX1BP61266 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
STX1BP61266 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
STX1BP61266 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX1BP61266 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
STX1BP61266 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1BP61266 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1BP61266 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1BP61266 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1BP61266 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
STX1BP61266 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
STX1BP61266 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
STX1BP61266 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
STX1BP61266 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1BP61266 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1BP61266 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
STX1BP61266 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1BP61266 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
STX1BP61266 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
STX1BP61266 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
STX1BP61266 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1BP61266 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
STX1BP61266 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
STX1BP61266 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
STX1BP61266 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1BP61266 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
STX1BP61266 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1BP61266 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
STX1BP61266 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
STX1BP61266 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
STX1BP61266 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1BP61266 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
STX1BP61266 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
STX1BP61266 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
STX1BP61266 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
STX1BP61266 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
STX1BP61266 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
STX1BP61266 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms