Protein–RNA interactions for Protein: P61020

RAB5B, Ras-related protein Rab-5B, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5BP61020 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB5BP61020 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB5BP61020 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB5BP61020 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB5BP61020 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB5BP61020 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB5BP61020 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB5BP61020 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RAB5BP61020 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RAB5BP61020 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB5BP61020 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB5BP61020 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB5BP61020 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RAB5BP61020 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RAB5BP61020 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms