Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
AP3S2P59780 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
AP3S2P59780 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3S2P59780 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3S2P59780 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3S2P59780 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3S2P59780 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3S2P59780 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3S2P59780 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3S2P59780 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AP3S2P59780 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AP3S2P59780 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms