Protein–RNA interactions for Protein: P58546

MTPN, Myotrophin, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTPNP58546 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTPNP58546 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
MTPNP58546 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTPNP58546 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MTPNP58546 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTPNP58546 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTPNP58546 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MTPNP58546 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTPNP58546 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MTPNP58546 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTPNP58546 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MTPNP58546 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MTPNP58546 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
MTPNP58546 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTPNP58546 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MTPNP58546 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
MTPNP58546 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTPNP58546 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MTPNP58546 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTPNP58546 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
MTPNP58546 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTPNP58546 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MTPNP58546 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MTPNP58546 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MTPNP58546 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MTPNP58546 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTPNP58546 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MTPNP58546 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
MTPNP58546 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MTPNP58546 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MTPNP58546 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MTPNP58546 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTPNP58546 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MTPNP58546 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MTPNP58546 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTPNP58546 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MTPNP58546 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTPNP58546 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MTPNP58546 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MTPNP58546 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTPNP58546 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTPNP58546 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTPNP58546 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MTPNP58546 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTPNP58546 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTPNP58546 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTPNP58546 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTPNP58546 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTPNP58546 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTPNP58546 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTPNP58546 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTPNP58546 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
MTPNP58546 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTPNP58546 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTPNP58546 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTPNP58546 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTPNP58546 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTPNP58546 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTPNP58546 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTPNP58546 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTPNP58546 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTPNP58546 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTPNP58546 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTPNP58546 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTPNP58546 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTPNP58546 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTPNP58546 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTPNP58546 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTPNP58546 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTPNP58546 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTPNP58546 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTPNP58546 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTPNP58546 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTPNP58546 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTPNP58546 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MTPNP58546 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTPNP58546 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MTPNP58546 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTPNP58546 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTPNP58546 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MTPNP58546 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MTPNP58546 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MTPNP58546 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTPNP58546 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTPNP58546 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTPNP58546 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MTPNP58546 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
MTPNP58546 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTPNP58546 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MTPNP58546 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTPNP58546 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MTPNP58546 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTPNP58546 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MTPNP58546 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTPNP58546 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MTPNP58546 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTPNP58546 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MTPNP58546 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTPNP58546 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MTPNP58546 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms