Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB25P57735 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB25P57735 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB25P57735 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB25P57735 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB25P57735 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB25P57735 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB25P57735 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB25P57735 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB25P57735 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB25P57735 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB25P57735 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB25P57735 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB25P57735 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB25P57735 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB25P57735 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RAB25P57735 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB25P57735 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB25P57735 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB25P57735 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB25P57735 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RAB25P57735 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB25P57735 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB25P57735 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB25P57735 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB25P57735 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RAB25P57735 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB25P57735 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RAB25P57735 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB25P57735 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB25P57735 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB25P57735 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB25P57735 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RAB25P57735 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RAB25P57735 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB25P57735 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB25P57735 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB25P57735 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB25P57735 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB25P57735 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB25P57735 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB25P57735 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RAB25P57735 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB25P57735 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB25P57735 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB25P57735 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB25P57735 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB25P57735 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB25P57735 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB25P57735 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB25P57735 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB25P57735 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB25P57735 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RAB25P57735 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RAB25P57735 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RAB25P57735 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB25P57735 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAB25P57735 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB25P57735 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAB25P57735 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB25P57735 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB25P57735 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB25P57735 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB25P57735 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAB25P57735 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB25P57735 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB25P57735 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAB25P57735 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB25P57735 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB25P57735 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB25P57735 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB25P57735 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAB25P57735 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAB25P57735 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB25P57735 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB25P57735 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB25P57735 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB25P57735 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB25P57735 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB25P57735 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB25P57735 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB25P57735 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RAB25P57735 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RAB25P57735 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB25P57735 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RAB25P57735 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB25P57735 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB25P57735 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RAB25P57735 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB25P57735 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB25P57735 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB25P57735 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB25P57735 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB25P57735 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB25P57735 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB25P57735 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB25P57735 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB25P57735 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB25P57735 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB25P57735 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms