Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM33P57088 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM33P57088 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM33P57088 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM33P57088 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM33P57088 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM33P57088 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM33P57088 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM33P57088 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM33P57088 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMEM33P57088 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMEM33P57088 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM33P57088 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMEM33P57088 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM33P57088 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms