Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX9P55771 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAX9P55771 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAX9P55771 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX9P55771 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PAX9P55771 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX9P55771 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX9P55771 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX9P55771 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PAX9P55771 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX9P55771 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PAX9P55771 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PAX9P55771 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX9P55771 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PAX9P55771 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PAX9P55771 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PAX9P55771 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PAX9P55771 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX9P55771 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PAX9P55771 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX9P55771 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX9P55771 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX9P55771 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PAX9P55771 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX9P55771 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX9P55771 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PAX9P55771 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX9P55771 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX9P55771 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PAX9P55771 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX9P55771 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PAX9P55771 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PAX9P55771 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX9P55771 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PAX9P55771 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX9P55771 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PAX9P55771 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PAX9P55771 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX9P55771 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX9P55771 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PAX9P55771 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PAX9P55771 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX9P55771 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PAX9P55771 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX9P55771 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX9P55771 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PAX9P55771 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PAX9P55771 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX9P55771 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX9P55771 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PAX9P55771 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PAX9P55771 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX9P55771 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX9P55771 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX9P55771 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX9P55771 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PAX9P55771 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX9P55771 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX9P55771 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PAX9P55771 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX9P55771 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX9P55771 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PAX9P55771 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX9P55771 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PAX9P55771 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX9P55771 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PAX9P55771 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PAX9P55771 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PAX9P55771 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PAX9P55771 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PAX9P55771 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX9P55771 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX9P55771 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX9P55771 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAX9P55771 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAX9P55771 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAX9P55771 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX9P55771 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PAX9P55771 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX9P55771 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX9P55771 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAX9P55771 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX9P55771 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAX9P55771 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX9P55771 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX9P55771 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAX9P55771 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAX9P55771 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX9P55771 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PAX9P55771 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAX9P55771 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX9P55771 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAX9P55771 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAX9P55771 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAX9P55771 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAX9P55771 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX9P55771 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX9P55771 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAX9P55771 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PAX9P55771 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms